レンタルサーババックアップ
ファーストサーバの件を受けて、
Windowsからバックアップを取るのなら、
以下のような情報が役立ちそうですね。
○FFFTPによるWebSiteの自動バックアップ方法
http://kazabana.tea-nifty.com/databackupmemo/2005/04/ffftpwebsite_4be6.html
○WinSCPスクリプト入門:コマンドやバッチファイルとの連携による自動処理
http://sourceforge.jp/magazine/10/04/20/1033216/3